Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
OBSCNQ5VST9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms