Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COL5A1-AS1Q5SY13 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COL5A1-AS1Q5SY13 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms