Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSJ5

HP1BP3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HP1BP3Q5SSJ5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms