Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALFQ53S48 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALFQ53S48 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms