Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C4orf17Q53FE4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C4orf17Q53FE4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms