Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKDCCQ504Y2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PKDCCQ504Y2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms