Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TMEM259Q4ZIN3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM259Q4ZIN3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms