Protein–RNA interactions for Protein: Q3MHD2

LSM12, Protein LSM12 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM12Q3MHD2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
LSM12Q3MHD2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LSM12Q3MHD2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms