Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL38Q2WGJ6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL38Q2WGJ6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms