Protein–RNA interactions for Protein: Q29980

MICB, MHC class I polypeptide-related sequence B, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICBQ29980 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MICBQ29980 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MICBQ29980 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MICBQ29980 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MICBQ29980 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MICBQ29980 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MICBQ29980 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MICBQ29980 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MICBQ29980 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MICBQ29980 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MICBQ29980 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MICBQ29980 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MICBQ29980 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MICBQ29980 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MICBQ29980 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MICBQ29980 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MICBQ29980 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MICBQ29980 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MICBQ29980 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MICBQ29980 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MICBQ29980 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MICBQ29980 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MICBQ29980 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MICBQ29980 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MICBQ29980 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MICBQ29980 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MICBQ29980 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MICBQ29980 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MICBQ29980 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MICBQ29980 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MICBQ29980 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MICBQ29980 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MICBQ29980 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MICBQ29980 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MICBQ29980 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MICBQ29980 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MICBQ29980 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MICBQ29980 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MICBQ29980 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MICBQ29980 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MICBQ29980 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MICBQ29980 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MICBQ29980 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MICBQ29980 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MICBQ29980 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MICBQ29980 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MICBQ29980 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MICBQ29980 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MICBQ29980 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MICBQ29980 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MICBQ29980 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MICBQ29980 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MICBQ29980 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MICBQ29980 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MICBQ29980 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MICBQ29980 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MICBQ29980 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MICBQ29980 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MICBQ29980 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MICBQ29980 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MICBQ29980 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MICBQ29980 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MICBQ29980 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MICBQ29980 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MICBQ29980 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MICBQ29980 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MICBQ29980 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MICBQ29980 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MICBQ29980 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MICBQ29980 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MICBQ29980 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
MICBQ29980 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MICBQ29980 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MICBQ29980 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MICBQ29980 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MICBQ29980 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MICBQ29980 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MICBQ29980 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MICBQ29980 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MICBQ29980 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MICBQ29980 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MICBQ29980 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MICBQ29980 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MICBQ29980 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MICBQ29980 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MICBQ29980 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MICBQ29980 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MICBQ29980 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MICBQ29980 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MICBQ29980 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MICBQ29980 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MICBQ29980 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MICBQ29980 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MICBQ29980 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MICBQ29980 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MICBQ29980 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MICBQ29980 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MICBQ29980 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MICBQ29980 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MICBQ29980 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms