Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIST3H3Q16695 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
HIST3H3Q16695 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIST3H3Q16695 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HIST3H3Q16695 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIST3H3Q16695 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIST3H3Q16695 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIST3H3Q16695 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIST3H3Q16695 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIST3H3Q16695 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIST3H3Q16695 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HIST3H3Q16695 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIST3H3Q16695 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIST3H3Q16695 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIST3H3Q16695 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIST3H3Q16695 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HIST3H3Q16695 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HIST3H3Q16695 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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