Protein–RNA interactions for Protein: Q16540

MRPL23, 39S ribosomal protein L23, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL23Q16540 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL23Q16540 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MRPL23Q16540 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MRPL23Q16540 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MRPL23Q16540 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MRPL23Q16540 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MRPL23Q16540 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MRPL23Q16540 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MRPL23Q16540 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MRPL23Q16540 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MRPL23Q16540 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
MRPL23Q16540 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MRPL23Q16540 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
MRPL23Q16540 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MRPL23Q16540 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MRPL23Q16540 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MRPL23Q16540 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MRPL23Q16540 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MRPL23Q16540 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MRPL23Q16540 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MRPL23Q16540 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MRPL23Q16540 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MRPL23Q16540 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MRPL23Q16540 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MRPL23Q16540 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MRPL23Q16540 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MRPL23Q16540 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MRPL23Q16540 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MRPL23Q16540 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MRPL23Q16540 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
MRPL23Q16540 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MRPL23Q16540 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MRPL23Q16540 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
MRPL23Q16540 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MRPL23Q16540 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MRPL23Q16540 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MRPL23Q16540 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MRPL23Q16540 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MRPL23Q16540 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPL23Q16540 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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