Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
DDB1Q16531 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
DDB1Q16531 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
DDB1Q16531 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
DDB1Q16531 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DDB1Q16531 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DDB1Q16531 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
DDB1Q16531 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
DDB1Q16531 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
DDB1Q16531 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DDB1Q16531 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
DDB1Q16531 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
DDB1Q16531 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
DDB1Q16531 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
DDB1Q16531 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DDB1Q16531 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DDB1Q16531 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDB1Q16531 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
DDB1Q16531 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDB1Q16531 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDB1Q16531 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
DDB1Q16531 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDB1Q16531 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDB1Q16531 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDB1Q16531 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDB1Q16531 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDB1Q16531 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDB1Q16531 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDB1Q16531 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDB1Q16531 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDB1Q16531 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDB1Q16531 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDB1Q16531 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDB1Q16531 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDB1Q16531 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDB1Q16531 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDB1Q16531 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDB1Q16531 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
DDB1Q16531 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDB1Q16531 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDB1Q16531 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDB1Q16531 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
DDB1Q16531 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDB1Q16531 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDB1Q16531 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDB1Q16531 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDB1Q16531 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDB1Q16531 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDB1Q16531 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDB1Q16531 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDB1Q16531 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDB1Q16531 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDB1Q16531 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDB1Q16531 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
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DDB1Q16531 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
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DDB1Q16531 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDB1Q16531 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDB1Q16531 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
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DDB1Q16531 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDB1Q16531 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDB1Q16531 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDB1Q16531 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
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DDB1Q16531 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
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DDB1Q16531 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDB1Q16531 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
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DDB1Q16531 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDB1Q16531 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDB1Q16531 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDB1Q16531 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDB1Q16531 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDB1Q16531 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDB1Q16531 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDB1Q16531 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDB1Q16531 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDB1Q16531 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
DDB1Q16531 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
DDB1Q16531 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDB1Q16531 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDB1Q16531 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDB1Q16531 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
DDB1Q16531 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDB1Q16531 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
DDB1Q16531 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDB1Q16531 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDB1Q16531 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDB1Q16531 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDB1Q16531 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDB1Q16531 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDB1Q16531 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
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