Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABRA6Q16445 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABRA6Q16445 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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