Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHRNA2Q15822 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CHRNA2Q15822 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHRNA2Q15822 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CHRNA2Q15822 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHRNA2Q15822 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHRNA2Q15822 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHRNA2Q15822 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHRNA2Q15822 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHRNA2Q15822 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHRNA2Q15822 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHRNA2Q15822 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHRNA2Q15822 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHRNA2Q15822 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHRNA2Q15822 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHRNA2Q15822 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHRNA2Q15822 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHRNA2Q15822 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHRNA2Q15822 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHRNA2Q15822 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHRNA2Q15822 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHRNA2Q15822 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CHRNA2Q15822 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CHRNA2Q15822 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
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