Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIP4Q15650 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIP4Q15650 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIP4Q15650 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIP4Q15650 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIP4Q15650 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIP4Q15650 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIP4Q15650 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIP4Q15650 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIP4Q15650 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIP4Q15650 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIP4Q15650 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIP4Q15650 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIP4Q15650 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIP4Q15650 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIP4Q15650 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIP4Q15650 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIP4Q15650 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIP4Q15650 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIP4Q15650 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIP4Q15650 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIP4Q15650 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIP4Q15650 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIP4Q15650 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIP4Q15650 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIP4Q15650 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIP4Q15650 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIP4Q15650 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRIP4Q15650 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIP4Q15650 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIP4Q15650 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIP4Q15650 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIP4Q15650 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIP4Q15650 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIP4Q15650 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIP4Q15650 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIP4Q15650 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIP4Q15650 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIP4Q15650 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIP4Q15650 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIP4Q15650 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIP4Q15650 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIP4Q15650 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIP4Q15650 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIP4Q15650 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIP4Q15650 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIP4Q15650 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIP4Q15650 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIP4Q15650 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIP4Q15650 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIP4Q15650 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIP4Q15650 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIP4Q15650 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIP4Q15650 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIP4Q15650 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIP4Q15650 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIP4Q15650 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIP4Q15650 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIP4Q15650 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIP4Q15650 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIP4Q15650 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIP4Q15650 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIP4Q15650 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIP4Q15650 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIP4Q15650 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIP4Q15650 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIP4Q15650 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIP4Q15650 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIP4Q15650 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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