Protein–RNA interactions for Protein: Q15323

KRT31, Keratin, type I cuticular Ha1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT31Q15323 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT31Q15323 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT31Q15323 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT31Q15323 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT31Q15323 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT31Q15323 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT31Q15323 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT31Q15323 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT31Q15323 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT31Q15323 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT31Q15323 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT31Q15323 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT31Q15323 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT31Q15323 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT31Q15323 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT31Q15323 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT31Q15323 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT31Q15323 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT31Q15323 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT31Q15323 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT31Q15323 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT31Q15323 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT31Q15323 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT31Q15323 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT31Q15323 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT31Q15323 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT31Q15323 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT31Q15323 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT31Q15323 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT31Q15323 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT31Q15323 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT31Q15323 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT31Q15323 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT31Q15323 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT31Q15323 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT31Q15323 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT31Q15323 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT31Q15323 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT31Q15323 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT31Q15323 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT31Q15323 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT31Q15323 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT31Q15323 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT31Q15323 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT31Q15323 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT31Q15323 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT31Q15323 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT31Q15323 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT31Q15323 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT31Q15323 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT31Q15323 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT31Q15323 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT31Q15323 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT31Q15323 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT31Q15323 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT31Q15323 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT31Q15323 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT31Q15323 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT31Q15323 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT31Q15323 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT31Q15323 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT31Q15323 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT31Q15323 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT31Q15323 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT31Q15323 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT31Q15323 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT31Q15323 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT31Q15323 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT31Q15323 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT31Q15323 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT31Q15323 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT31Q15323 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT31Q15323 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms