Protein–RNA interactions for Protein: Q15291

RBBP5, Retinoblastoma-binding protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP5Q15291 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
RBBP5Q15291 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RBBP5Q15291 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RBBP5Q15291 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RBBP5Q15291 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RBBP5Q15291 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RBBP5Q15291 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RBBP5Q15291 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RBBP5Q15291 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RBBP5Q15291 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
RBBP5Q15291 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RBBP5Q15291 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RBBP5Q15291 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RBBP5Q15291 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RBBP5Q15291 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RBBP5Q15291 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms