Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
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BRD3Q15059 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
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BRD3Q15059 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRD3Q15059 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
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