Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KARSQ15046 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KARSQ15046 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KARSQ15046 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KARSQ15046 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KARSQ15046 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KARSQ15046 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KARSQ15046 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KARSQ15046 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KARSQ15046 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KARSQ15046 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KARSQ15046 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KARSQ15046 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KARSQ15046 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KARSQ15046 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KARSQ15046 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KARSQ15046 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KARSQ15046 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KARSQ15046 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KARSQ15046 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KARSQ15046 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KARSQ15046 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KARSQ15046 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KARSQ15046 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KARSQ15046 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KARSQ15046 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KARSQ15046 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KARSQ15046 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
KARSQ15046 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KARSQ15046 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KARSQ15046 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KARSQ15046 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KARSQ15046 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KARSQ15046 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KARSQ15046 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KARSQ15046 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KARSQ15046 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
KARSQ15046 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KARSQ15046 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KARSQ15046 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KARSQ15046 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KARSQ15046 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
KARSQ15046 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KARSQ15046 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KARSQ15046 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KARSQ15046 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KARSQ15046 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KARSQ15046 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KARSQ15046 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KARSQ15046 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KARSQ15046 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KARSQ15046 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KARSQ15046 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KARSQ15046 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KARSQ15046 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KARSQ15046 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KARSQ15046 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KARSQ15046 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KARSQ15046 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KARSQ15046 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KARSQ15046 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KARSQ15046 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KARSQ15046 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KARSQ15046 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KARSQ15046 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KARSQ15046 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KARSQ15046 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KARSQ15046 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KARSQ15046 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KARSQ15046 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KARSQ15046 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KARSQ15046 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KARSQ15046 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KARSQ15046 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KARSQ15046 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KARSQ15046 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KARSQ15046 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KARSQ15046 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KARSQ15046 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KARSQ15046 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KARSQ15046 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KARSQ15046 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KARSQ15046 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KARSQ15046 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KARSQ15046 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KARSQ15046 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KARSQ15046 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KARSQ15046 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KARSQ15046 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KARSQ15046 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KARSQ15046 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KARSQ15046 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KARSQ15046 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KARSQ15046 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KARSQ15046 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KARSQ15046 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
KARSQ15046 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KARSQ15046 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KARSQ15046 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KARSQ15046 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
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