Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERPUD1Q15011 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERPUD1Q15011 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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