Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IHHQ14623 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IHHQ14623 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IHHQ14623 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IHHQ14623 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IHHQ14623 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IHHQ14623 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IHHQ14623 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IHHQ14623 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IHHQ14623 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IHHQ14623 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IHHQ14623 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IHHQ14623 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IHHQ14623 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IHHQ14623 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
IHHQ14623 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IHHQ14623 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IHHQ14623 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IHHQ14623 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IHHQ14623 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IHHQ14623 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IHHQ14623 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IHHQ14623 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IHHQ14623 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IHHQ14623 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
IHHQ14623 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IHHQ14623 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IHHQ14623 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IHHQ14623 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IHHQ14623 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
IHHQ14623 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IHHQ14623 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IHHQ14623 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IHHQ14623 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IHHQ14623 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IHHQ14623 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
IHHQ14623 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IHHQ14623 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IHHQ14623 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IHHQ14623 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IHHQ14623 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IHHQ14623 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IHHQ14623 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IHHQ14623 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
IHHQ14623 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IHHQ14623 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IHHQ14623 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IHHQ14623 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IHHQ14623 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IHHQ14623 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IHHQ14623 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IHHQ14623 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IHHQ14623 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IHHQ14623 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
IHHQ14623 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IHHQ14623 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IHHQ14623 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IHHQ14623 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IHHQ14623 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IHHQ14623 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IHHQ14623 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IHHQ14623 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IHHQ14623 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IHHQ14623 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IHHQ14623 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IHHQ14623 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IHHQ14623 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IHHQ14623 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IHHQ14623 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IHHQ14623 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IHHQ14623 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IHHQ14623 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IHHQ14623 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IHHQ14623 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IHHQ14623 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IHHQ14623 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IHHQ14623 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IHHQ14623 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
IHHQ14623 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IHHQ14623 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IHHQ14623 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IHHQ14623 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IHHQ14623 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IHHQ14623 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IHHQ14623 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IHHQ14623 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IHHQ14623 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IHHQ14623 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
IHHQ14623 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IHHQ14623 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IHHQ14623 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IHHQ14623 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IHHQ14623 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IHHQ14623 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IHHQ14623 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IHHQ14623 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IHHQ14623 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IHHQ14623 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IHHQ14623 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IHHQ14623 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms