Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SQLEQ14534 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SQLEQ14534 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms