Protein–RNA interactions for Protein: Q13901

C1D, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1DQ13901 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C1DQ13901 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C1DQ13901 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
C1DQ13901 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C1DQ13901 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C1DQ13901 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C1DQ13901 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C1DQ13901 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C1DQ13901 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C1DQ13901 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C1DQ13901 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C1DQ13901 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
C1DQ13901 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
C1DQ13901 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C1DQ13901 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C1DQ13901 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
C1DQ13901 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
C1DQ13901 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
C1DQ13901 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C1DQ13901 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C1DQ13901 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C1DQ13901 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C1DQ13901 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C1DQ13901 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C1DQ13901 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C1DQ13901 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C1DQ13901 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C1DQ13901 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C1DQ13901 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
C1DQ13901 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
C1DQ13901 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
C1DQ13901 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C1DQ13901 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C1DQ13901 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C1DQ13901 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C1DQ13901 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C1DQ13901 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C1DQ13901 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C1DQ13901 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C1DQ13901 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C1DQ13901 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C1DQ13901 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C1DQ13901 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C1DQ13901 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C1DQ13901 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C1DQ13901 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C1DQ13901 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C1DQ13901 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C1DQ13901 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C1DQ13901 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
C1DQ13901 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C1DQ13901 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C1DQ13901 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C1DQ13901 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C1DQ13901 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C1DQ13901 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C1DQ13901 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C1DQ13901 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1DQ13901 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1DQ13901 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1DQ13901 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1DQ13901 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1DQ13901 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1DQ13901 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1DQ13901 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1DQ13901 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1DQ13901 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1DQ13901 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1DQ13901 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1DQ13901 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1DQ13901 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
C1DQ13901 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1DQ13901 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1DQ13901 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1DQ13901 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C1DQ13901 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C1DQ13901 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C1DQ13901 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C1DQ13901 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C1DQ13901 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C1DQ13901 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C1DQ13901 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C1DQ13901 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C1DQ13901 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C1DQ13901 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C1DQ13901 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C1DQ13901 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C1DQ13901 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C1DQ13901 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C1DQ13901 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C1DQ13901 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C1DQ13901 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C1DQ13901 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C1DQ13901 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C1DQ13901 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C1DQ13901 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C1DQ13901 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C1DQ13901 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C1DQ13901 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C1DQ13901 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms