Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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ITGA9Q13797 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGA9Q13797 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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