Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DNASE1L3Q13609 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms