Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD4Q13485 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD4Q13485 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD4Q13485 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD4Q13485 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD4Q13485 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD4Q13485 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD4Q13485 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD4Q13485 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD4Q13485 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD4Q13485 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD4Q13485 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD4Q13485 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD4Q13485 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD4Q13485 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD4Q13485 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD4Q13485 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD4Q13485 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD4Q13485 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD4Q13485 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD4Q13485 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMAD4Q13485 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMAD4Q13485 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SMAD4Q13485 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMAD4Q13485 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMAD4Q13485 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMAD4Q13485 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SMAD4Q13485 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMAD4Q13485 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMAD4Q13485 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMAD4Q13485 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMAD4Q13485 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD4Q13485 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD4Q13485 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD4Q13485 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD4Q13485 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD4Q13485 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD4Q13485 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD4Q13485 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD4Q13485 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD4Q13485 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD4Q13485 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD4Q13485 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD4Q13485 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD4Q13485 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD4Q13485 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD4Q13485 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SMAD4Q13485 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMAD4Q13485 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMAD4Q13485 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMAD4Q13485 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMAD4Q13485 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMAD4Q13485 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMAD4Q13485 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMAD4Q13485 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMAD4Q13485 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMAD4Q13485 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAD4Q13485 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
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