Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TOP3AQ13472 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TOP3AQ13472 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
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