Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
XRCC4Q13426 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
XRCC4Q13426 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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