Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGDRQ13258 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTGDRQ13258 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTGDRQ13258 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTGDRQ13258 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTGDRQ13258 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PTGDRQ13258 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTGDRQ13258 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTGDRQ13258 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTGDRQ13258 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTGDRQ13258 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTGDRQ13258 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTGDRQ13258 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTGDRQ13258 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTGDRQ13258 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PTGDRQ13258 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTGDRQ13258 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTGDRQ13258 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTGDRQ13258 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTGDRQ13258 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTGDRQ13258 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PTGDRQ13258 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTGDRQ13258 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
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