Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC10A2Q12908 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC10A2Q12908 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC10A2Q12908 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC10A2Q12908 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC10A2Q12908 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC10A2Q12908 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC10A2Q12908 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC10A2Q12908 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC10A2Q12908 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC10A2Q12908 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC10A2Q12908 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC10A2Q12908 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC10A2Q12908 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC10A2Q12908 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC10A2Q12908 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC10A2Q12908 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC10A2Q12908 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC10A2Q12908 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC10A2Q12908 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC10A2Q12908 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC10A2Q12908 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC10A2Q12908 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC10A2Q12908 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC10A2Q12908 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC10A2Q12908 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC10A2Q12908 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC10A2Q12908 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC10A2Q12908 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC10A2Q12908 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC10A2Q12908 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC10A2Q12908 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC10A2Q12908 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC10A2Q12908 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC10A2Q12908 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC10A2Q12908 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC10A2Q12908 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC10A2Q12908 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC10A2Q12908 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC10A2Q12908 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC10A2Q12908 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC10A2Q12908 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC10A2Q12908 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC10A2Q12908 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC10A2Q12908 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC10A2Q12908 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC10A2Q12908 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC10A2Q12908 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC10A2Q12908 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC10A2Q12908 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC10A2Q12908 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC10A2Q12908 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC10A2Q12908 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC10A2Q12908 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC10A2Q12908 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC10A2Q12908 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC10A2Q12908 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC10A2Q12908 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC10A2Q12908 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC10A2Q12908 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC10A2Q12908 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC10A2Q12908 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC10A2Q12908 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC10A2Q12908 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC10A2Q12908 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC10A2Q12908 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC10A2Q12908 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC10A2Q12908 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC10A2Q12908 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC10A2Q12908 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC10A2Q12908 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC10A2Q12908 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC10A2Q12908 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC10A2Q12908 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC10A2Q12908 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC10A2Q12908 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC10A2Q12908 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC10A2Q12908 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC10A2Q12908 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC10A2Q12908 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC10A2Q12908 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC10A2Q12908 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC10A2Q12908 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC10A2Q12908 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC10A2Q12908 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC10A2Q12908 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC10A2Q12908 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC10A2Q12908 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC10A2Q12908 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC10A2Q12908 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC10A2Q12908 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC10A2Q12908 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC10A2Q12908 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC10A2Q12908 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC10A2Q12908 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC10A2Q12908 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC10A2Q12908 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC10A2Q12908 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC10A2Q12908 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC10A2Q12908 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms