Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
TROQ12816 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
TROQ12816 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
TROQ12816 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
TROQ12816 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
TROQ12816 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
TROQ12816 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
TROQ12816 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
TROQ12816 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
TROQ12816 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
TROQ12816 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
TROQ12816 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
TROQ12816 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
TROQ12816 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
TROQ12816 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
TROQ12816 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
TROQ12816 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.84■■■□□ 2.85
TROQ12816 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
TROQ12816 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
TROQ12816 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
TROQ12816 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
TROQ12816 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
TROQ12816 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
TROQ12816 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
TROQ12816 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
TROQ12816 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
TROQ12816 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
TROQ12816 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
TROQ12816 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
TROQ12816 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
TROQ12816 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
TROQ12816 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
TROQ12816 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
TROQ12816 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC32.82■■■□□ 2.84
TROQ12816 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
TROQ12816 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
TROQ12816 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
TROQ12816 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
TROQ12816 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
TROQ12816 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
TROQ12816 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
TROQ12816 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
TROQ12816 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
TROQ12816 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
TROQ12816 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
TROQ12816 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
TROQ12816 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
TROQ12816 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
TROQ12816 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
TROQ12816 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
TROQ12816 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
TROQ12816 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TROQ12816 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TROQ12816 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
TROQ12816 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC32.79■■■□□ 2.84
TROQ12816 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TROQ12816 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TROQ12816 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TROQ12816 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TROQ12816 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TROQ12816 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TROQ12816 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TROQ12816 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
TROQ12816 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
TROQ12816 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TROQ12816 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TROQ12816 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
TROQ12816 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TROQ12816 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TROQ12816 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TROQ12816 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TROQ12816 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TROQ12816 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
TROQ12816 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
TROQ12816 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TROQ12816 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TROQ12816 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TROQ12816 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TROQ12816 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TROQ12816 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
TROQ12816 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
TROQ12816 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
TROQ12816 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
TROQ12816 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
TROQ12816 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
TROQ12816 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
TROQ12816 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
TROQ12816 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
TROQ12816 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
TROQ12816 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
TROQ12816 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
TROQ12816 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
TROQ12816 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
TROQ12816 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
TROQ12816 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
TROQ12816 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
TROQ12816 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
TROQ12816 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
TROQ12816 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
TROQ12816 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
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