Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAGPQ0VAQ4 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms