Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
C2orf54Q08AI8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C2orf54Q08AI8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms