Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE4CQ08493 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms