Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LOXL1Q08397 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LOXL1Q08397 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms