Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
GOLGA3Q08378 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
GOLGA3Q08378 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
GOLGA3Q08378 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
GOLGA3Q08378 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
GOLGA3Q08378 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
GOLGA3Q08378 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
GOLGA3Q08378 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
GOLGA3Q08378 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
GOLGA3Q08378 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
GOLGA3Q08378 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
GOLGA3Q08378 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
GOLGA3Q08378 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC34.61■■■■□ 3.13
GOLGA3Q08378 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
GOLGA3Q08378 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
GOLGA3Q08378 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
GOLGA3Q08378 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
GOLGA3Q08378 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
GOLGA3Q08378 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
GOLGA3Q08378 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
GOLGA3Q08378 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
GOLGA3Q08378 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
GOLGA3Q08378 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
GOLGA3Q08378 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
GOLGA3Q08378 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
GOLGA3Q08378 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
GOLGA3Q08378 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
GOLGA3Q08378 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
GOLGA3Q08378 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
GOLGA3Q08378 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
GOLGA3Q08378 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
GOLGA3Q08378 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
GOLGA3Q08378 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
GOLGA3Q08378 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
GOLGA3Q08378 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
GOLGA3Q08378 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
GOLGA3Q08378 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
GOLGA3Q08378 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
GOLGA3Q08378 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC34.58■■■■□ 3.13
GOLGA3Q08378 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
GOLGA3Q08378 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
GOLGA3Q08378 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
GOLGA3Q08378 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
GOLGA3Q08378 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
GOLGA3Q08378 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
GOLGA3Q08378 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
GOLGA3Q08378 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
GOLGA3Q08378 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
GOLGA3Q08378 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
GOLGA3Q08378 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
GOLGA3Q08378 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.13
GOLGA3Q08378 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
GOLGA3Q08378 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
GOLGA3Q08378 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
GOLGA3Q08378 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
GOLGA3Q08378 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
GOLGA3Q08378 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
GOLGA3Q08378 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
GOLGA3Q08378 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
GOLGA3Q08378 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
GOLGA3Q08378 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
GOLGA3Q08378 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
GOLGA3Q08378 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
GOLGA3Q08378 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
GOLGA3Q08378 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
GOLGA3Q08378 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
GOLGA3Q08378 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
GOLGA3Q08378 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
GOLGA3Q08378 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
GOLGA3Q08378 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
GOLGA3Q08378 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
GOLGA3Q08378 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
GOLGA3Q08378 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
GOLGA3Q08378 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
GOLGA3Q08378 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
GOLGA3Q08378 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
GOLGA3Q08378 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
GOLGA3Q08378 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
GOLGA3Q08378 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
GOLGA3Q08378 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
GOLGA3Q08378 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
GOLGA3Q08378 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
GOLGA3Q08378 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
GOLGA3Q08378 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
GOLGA3Q08378 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
GOLGA3Q08378 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
GOLGA3Q08378 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
GOLGA3Q08378 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
GOLGA3Q08378 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
GOLGA3Q08378 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
GOLGA3Q08378 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
GOLGA3Q08378 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
GOLGA3Q08378 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
GOLGA3Q08378 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC34.52■■■■□ 3.12
GOLGA3Q08378 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
GOLGA3Q08378 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
GOLGA3Q08378 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
GOLGA3Q08378 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
GOLGA3Q08378 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
GOLGA3Q08378 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms