Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CACNB2Q08289 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CACNB2Q08289 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms