Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
DHX9Q08211 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DHX9Q08211 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DHX9Q08211 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
DHX9Q08211 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DHX9Q08211 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DHX9Q08211 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DHX9Q08211 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DHX9Q08211 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DHX9Q08211 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
DHX9Q08211 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DHX9Q08211 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DHX9Q08211 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DHX9Q08211 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DHX9Q08211 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DHX9Q08211 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DHX9Q08211 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DHX9Q08211 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DHX9Q08211 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DHX9Q08211 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DHX9Q08211 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DHX9Q08211 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DHX9Q08211 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DHX9Q08211 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DHX9Q08211 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DHX9Q08211 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DHX9Q08211 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DHX9Q08211 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DHX9Q08211 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
DHX9Q08211 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
DHX9Q08211 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DHX9Q08211 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DHX9Q08211 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DHX9Q08211 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DHX9Q08211 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DHX9Q08211 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DHX9Q08211 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DHX9Q08211 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DHX9Q08211 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DHX9Q08211 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DHX9Q08211 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DHX9Q08211 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DHX9Q08211 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DHX9Q08211 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DHX9Q08211 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DHX9Q08211 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DHX9Q08211 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DHX9Q08211 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DHX9Q08211 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DHX9Q08211 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DHX9Q08211 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DHX9Q08211 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DHX9Q08211 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DHX9Q08211 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DHX9Q08211 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DHX9Q08211 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DHX9Q08211 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DHX9Q08211 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DHX9Q08211 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DHX9Q08211 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DHX9Q08211 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DHX9Q08211 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DHX9Q08211 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DHX9Q08211 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DHX9Q08211 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DHX9Q08211 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DHX9Q08211 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DHX9Q08211 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DHX9Q08211 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DHX9Q08211 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms