Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLC3A1Q07837 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC3A1Q07837 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC3A1Q07837 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC3A1Q07837 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC3A1Q07837 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC3A1Q07837 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC3A1Q07837 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC3A1Q07837 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC3A1Q07837 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC3A1Q07837 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC3A1Q07837 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC3A1Q07837 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC3A1Q07837 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC3A1Q07837 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC3A1Q07837 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC3A1Q07837 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC3A1Q07837 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC3A1Q07837 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC3A1Q07837 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC3A1Q07837 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC3A1Q07837 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC3A1Q07837 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC3A1Q07837 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC3A1Q07837 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC3A1Q07837 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC3A1Q07837 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC3A1Q07837 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC3A1Q07837 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC3A1Q07837 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC3A1Q07837 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC3A1Q07837 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC3A1Q07837 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC3A1Q07837 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC3A1Q07837 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC3A1Q07837 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC3A1Q07837 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC3A1Q07837 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC3A1Q07837 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC3A1Q07837 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC3A1Q07837 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC3A1Q07837 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms