Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN11Q06124 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN11Q06124 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms