Protein–RNA interactions for Protein: Q04741

EMX1, Homeobox protein EMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX1Q04741 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EMX1Q04741 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EMX1Q04741 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EMX1Q04741 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EMX1Q04741 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EMX1Q04741 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EMX1Q04741 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EMX1Q04741 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EMX1Q04741 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EMX1Q04741 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EMX1Q04741 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EMX1Q04741 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EMX1Q04741 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EMX1Q04741 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
EMX1Q04741 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EMX1Q04741 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EMX1Q04741 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EMX1Q04741 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
EMX1Q04741 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EMX1Q04741 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EMX1Q04741 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EMX1Q04741 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EMX1Q04741 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EMX1Q04741 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EMX1Q04741 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EMX1Q04741 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EMX1Q04741 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EMX1Q04741 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EMX1Q04741 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EMX1Q04741 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EMX1Q04741 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EMX1Q04741 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EMX1Q04741 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EMX1Q04741 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EMX1Q04741 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EMX1Q04741 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EMX1Q04741 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EMX1Q04741 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EMX1Q04741 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EMX1Q04741 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EMX1Q04741 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EMX1Q04741 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EMX1Q04741 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EMX1Q04741 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EMX1Q04741 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EMX1Q04741 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EMX1Q04741 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EMX1Q04741 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EMX1Q04741 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EMX1Q04741 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EMX1Q04741 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EMX1Q04741 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EMX1Q04741 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EMX1Q04741 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EMX1Q04741 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EMX1Q04741 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EMX1Q04741 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EMX1Q04741 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EMX1Q04741 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EMX1Q04741 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EMX1Q04741 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EMX1Q04741 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EMX1Q04741 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EMX1Q04741 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EMX1Q04741 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EMX1Q04741 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EMX1Q04741 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EMX1Q04741 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EMX1Q04741 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EMX1Q04741 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
EMX1Q04741 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
EMX1Q04741 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EMX1Q04741 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms