Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ID3Q02535 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ID3Q02535 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ID3Q02535 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ID3Q02535 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ID3Q02535 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ID3Q02535 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ID3Q02535 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ID3Q02535 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ID3Q02535 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ID3Q02535 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ID3Q02535 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ID3Q02535 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ID3Q02535 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ID3Q02535 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ID3Q02535 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ID3Q02535 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ID3Q02535 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ID3Q02535 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ID3Q02535 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ID3Q02535 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ID3Q02535 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ID3Q02535 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ID3Q02535 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ID3Q02535 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ID3Q02535 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ID3Q02535 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ID3Q02535 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ID3Q02535 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ID3Q02535 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ID3Q02535 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ID3Q02535 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ID3Q02535 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ID3Q02535 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ID3Q02535 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ID3Q02535 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ID3Q02535 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ID3Q02535 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ID3Q02535 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ID3Q02535 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ID3Q02535 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ID3Q02535 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ID3Q02535 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ID3Q02535 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ID3Q02535 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ID3Q02535 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ID3Q02535 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ID3Q02535 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ID3Q02535 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ID3Q02535 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ID3Q02535 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ID3Q02535 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ID3Q02535 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ID3Q02535 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ID3Q02535 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ID3Q02535 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ID3Q02535 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ID3Q02535 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ID3Q02535 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ID3Q02535 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ID3Q02535 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ID3Q02535 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ID3Q02535 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ID3Q02535 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ID3Q02535 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ID3Q02535 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ID3Q02535 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ID3Q02535 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ID3Q02535 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ID3Q02535 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ID3Q02535 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ID3Q02535 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ID3Q02535 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ID3Q02535 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ID3Q02535 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ID3Q02535 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ID3Q02535 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ID3Q02535 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ID3Q02535 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ID3Q02535 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ID3Q02535 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ID3Q02535 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ID3Q02535 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ID3Q02535 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ID3Q02535 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ID3Q02535 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ID3Q02535 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ID3Q02535 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ID3Q02535 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ID3Q02535 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ID3Q02535 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ID3Q02535 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ID3Q02535 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ID3Q02535 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ID3Q02535 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ID3Q02535 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ID3Q02535 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ID3Q02535 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ID3Q02535 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ID3Q02535 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms