Protein–RNA interactions for Protein: Q02505

MUC3A, Mucin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 3,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC3AQ02505 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
MUC3AQ02505 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MUC3AQ02505 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MUC3AQ02505 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MUC3AQ02505 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MUC3AQ02505 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MUC3AQ02505 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MUC3AQ02505 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MUC3AQ02505 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MUC3AQ02505 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MUC3AQ02505 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MUC3AQ02505 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MUC3AQ02505 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MUC3AQ02505 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MUC3AQ02505 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MUC3AQ02505 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MUC3AQ02505 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MUC3AQ02505 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MUC3AQ02505 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MUC3AQ02505 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MUC3AQ02505 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MUC3AQ02505 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MUC3AQ02505 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MUC3AQ02505 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MUC3AQ02505 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MUC3AQ02505 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MUC3AQ02505 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MUC3AQ02505 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MUC3AQ02505 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MUC3AQ02505 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MUC3AQ02505 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MUC3AQ02505 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MUC3AQ02505 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MUC3AQ02505 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MUC3AQ02505 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MUC3AQ02505 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MUC3AQ02505 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MUC3AQ02505 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MUC3AQ02505 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MUC3AQ02505 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MUC3AQ02505 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MUC3AQ02505 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MUC3AQ02505 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MUC3AQ02505 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MUC3AQ02505 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MUC3AQ02505 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MUC3AQ02505 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MUC3AQ02505 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MUC3AQ02505 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MUC3AQ02505 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MUC3AQ02505 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MUC3AQ02505 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MUC3AQ02505 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MUC3AQ02505 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MUC3AQ02505 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MUC3AQ02505 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MUC3AQ02505 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MUC3AQ02505 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MUC3AQ02505 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MUC3AQ02505 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MUC3AQ02505 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MUC3AQ02505 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MUC3AQ02505 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MUC3AQ02505 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MUC3AQ02505 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MUC3AQ02505 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MUC3AQ02505 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MUC3AQ02505 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MUC3AQ02505 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MUC3AQ02505 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms