Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDR2Q01850 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms