Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
DEFA6Q01524 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms