Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FANCCQ00597 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FANCCQ00597 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms