Protein–RNA interactions for Protein: Q00266

MAT1A, S-adenosylmethionine synthase isoform type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAT1AQ00266 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MAT1AQ00266 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms