Protein–RNA interactions for Protein: P78364

PHC1, Polyhomeotic-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC1P78364 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHC1P78364 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHC1P78364 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHC1P78364 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHC1P78364 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHC1P78364 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHC1P78364 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHC1P78364 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHC1P78364 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PHC1P78364 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHC1P78364 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHC1P78364 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHC1P78364 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHC1P78364 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHC1P78364 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHC1P78364 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHC1P78364 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHC1P78364 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHC1P78364 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHC1P78364 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PHC1P78364 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHC1P78364 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHC1P78364 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHC1P78364 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHC1P78364 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHC1P78364 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHC1P78364 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHC1P78364 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHC1P78364 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHC1P78364 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHC1P78364 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHC1P78364 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHC1P78364 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHC1P78364 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHC1P78364 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHC1P78364 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHC1P78364 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHC1P78364 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHC1P78364 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHC1P78364 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHC1P78364 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHC1P78364 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHC1P78364 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHC1P78364 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHC1P78364 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHC1P78364 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHC1P78364 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHC1P78364 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHC1P78364 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHC1P78364 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHC1P78364 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHC1P78364 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHC1P78364 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHC1P78364 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHC1P78364 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHC1P78364 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHC1P78364 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHC1P78364 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHC1P78364 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHC1P78364 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHC1P78364 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHC1P78364 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHC1P78364 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHC1P78364 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHC1P78364 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHC1P78364 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHC1P78364 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHC1P78364 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHC1P78364 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHC1P78364 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHC1P78364 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PHC1P78364 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHC1P78364 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHC1P78364 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PHC1P78364 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHC1P78364 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHC1P78364 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHC1P78364 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHC1P78364 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHC1P78364 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHC1P78364 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHC1P78364 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHC1P78364 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHC1P78364 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHC1P78364 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHC1P78364 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHC1P78364 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHC1P78364 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHC1P78364 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHC1P78364 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHC1P78364 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHC1P78364 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHC1P78364 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHC1P78364 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHC1P78364 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PHC1P78364 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHC1P78364 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHC1P78364 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHC1P78364 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHC1P78364 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms