Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TUBB4BP68371 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms